Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms