Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms