Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms