Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms