Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT76Q01546 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT76Q01546 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms