Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms