Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms