Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms