Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms