Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIM2P55344 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIM2P55344 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIM2P55344 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIM2P55344 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms