Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms