Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIMK2P53671 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms