Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTDSS1P48651 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms