Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX3P48380 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms