Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRATP43155 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms