Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms