Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms