Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GGCXP38435 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms