Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms