Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms