Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-FP30511 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms