Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms