Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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