Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms