Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms