Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRBP23467 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRBP23467 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRBP23467 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPRBP23467 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPRBP23467 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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