Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1PR1P21453 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms