Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRHP20396 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRHP20396 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRHP20396 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRHP20396 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRHP20396 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms