Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms