Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VCLP18206 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VCLP18206 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VCLP18206 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VCLP18206 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms