Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFLP07196 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFLP07196 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms