Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGF1P05230 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGF1P05230 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGF1P05230 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms