Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSI1O43347 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms