Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNJ2O15056 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms