Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CLGNO14967 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLGNO14967 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLGNO14967 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms