Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms