Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms