Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPA5E9PKD4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms