Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms