Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms