Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms