Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms