Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms