Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR55Q9Y2T6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR55Q9Y2T6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR55Q9Y2T6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR55Q9Y2T6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR55Q9Y2T6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms