Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAN1Q9Y2M0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms