Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms