Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms