Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms