Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms