Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms